農作物在收獲后，剩下的秸稈廢棄物很難處理。過去采用焚燒的方式處理，但會造成嚴重的環境污染。如果將其加工成為肥料或燃料，可以實現資源的二次利用。以小型秸稈有機肥生產線投資為例，秸稈本身含有大量的有機質，干物質、灰分、氮磷鉀等營養成分，通過肥料生產設備將其加工為有機肥確實是不錯的選擇。

我們知道，通常有機肥原料以養殖業所產生的畜禽糞便居多。首先養殖業的發展形勢很好，規模化養殖場數量較多，保證了原料的供應；其次畜禽糞便便于運輸然后集中處理，含水率低的物料可以直接轉運，含水率高的則可以通過固液分離機進行脫水后再進行運輸，這些都是糞便有機肥的優勢。

而有機肥生產線利用秸稈作為原料，雖然從營養成分上來講是個很不錯的選擇，但是在收集上就不如畜禽糞便那樣方便，當然對于大規模農作物種植來說相對好些。有些有機肥廠使用的是大棚蔬菜收獲后剩余的藤來作為原料，因為難免會混有塑料薄膜這些殘留物，前期原料篩分也是個必要的過程。

在秸稈原料充足的情況下，可以建設大型秸稈有機肥生產線，這樣工廠的生產環境也較畜禽糞便有機肥廠好很多。在秸稈原料分散，并不是很充足的情況下，可以選擇以畜禽糞便為主料，秸稈為輔料的生產方式來生產有機肥，這樣秸稈不僅可以吸收糞便中多余的水分，而且可以調整其固有的成品配比，生產出合適的有機肥產品。

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